作業分為4個階段，東電已公佈最初10年的計劃。留在各個機組水池內的乏燃料取出作業將在2027年度從1號機組開始著手。東電表示將在反應堆完成報廢前將燃料運至縣外，但大致時間尚無法預計。反應堆報廢作業的4個階段分別為：(1)污染調查和去污；(2)拆除周邊設備；(3)拆除反應堆；(4)拆除反應堆廠房。去年6月已開始去污和拆除戶外設備。1至4號機組共保管有9532根乏燃料和544根新燃料，將在第三階段開始前完成取出作業。在1號機組之後，2028年度將開始在4號機組實施燃料取出作業。1號、4號機組靠近設施用地邊緣，與2號、3號機組相比對周圍的輻射風險高，故而優先處理。
福島二核與一核不同，未發生堆芯熔化和氫氣爆炸，用於取出燃料的起重機等可以直接使用，預計取出作業本身沒有障礙。搬運出來的燃料將在用地內新設的貯藏設施保管，放入金屬容器中進行氣冷。貯藏設施設想的容量為5000根左右，但也考慮根據搬運計劃進行增設。
在東日本大地震中，福島二核1號、2號、4號機組一度喪失冷卻功能但得以修復，未造成嚴重事故。後來因當地認為其“對重建構成障礙”的意見強烈，東電於2019年7月決定報廢。
另據日本《每日新聞》29日報導，距日本福島核電站僅3公里的“大熊町圖書館‧民俗傳承館”27日在福島核事故後首次重新開放，並免費給居民送藏書。這家圖書館位於曾經受核污染嚴重區域，時隔11年重開，書送完後將被拆解。這家圖書館有藏書13萬冊，僅開放27日至30日四天時間。大熊町政府表示，13萬冊藏書中，政府將保存鄉土資料等2萬冊，另一部分免費發放給個人、團體及福島縣內其他圖書館，剩餘的書將隨著圖書館建築拆解而被廢棄◆
