方濟各2013年就任以來，反覆呼籲廢核的必要性。他對世界各地戰爭持續的現狀表示擔憂，發言稱從廣島與長崎原子彈爆炸的歷史中“人類未學到任何教訓”。此外還於2017年在梵蒂岡與核爆受害者見面時對持有核武器明確予以批評，成為歷代教皇中的第一人。對於據稱原子彈投下後在長崎拍攝的照片《站在火葬場的少年》，方濟各附上“戰爭所帶來的結果”這一訊息並分發給身邊之人等，一直對核爆地十分關心。
方濟各定於25日與日本首相安倍晉三舉行會談，是否會要求作為唯一核爆受害國卻未加入《禁止核武器條約》的日本政府批准該條約及勸說日本廢除死刑制度受到關注。方濟各去年8月提出了教會今後不容許一切死刑的方針。
方濟各25日將會晤天皇並在東京巨蛋舉行大規模彌撒。出身於將基督教傳至日本的聖方濟各‧沙勿略等創辦的耶穌會的方濟各26日將訪問該會作為母體開設的上智大學，之後離開日本。
安倍2014年在梵蒂岡與方濟各舉行會談，邀請其訪日。2017年至2018年，廣島縣知事、廣島市市長以及長崎市市長等先後出席過方濟各的例行接見活動，邀請其訪問核爆地◆
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