在向北部、中部各省市卫生厅厅长致送关于加强台风与洪涝前后的疫情防控工作《文本》中，卫生部所属卫生防疫局提议各单位首长紧急指导复查并评价很有可能受台风与洪涝影响地区的疫情隐患，尤其是低洼地区、严重水淹与洪雨袭击地区。
各单位主动指引各项疫情防控措施，尤其是爆发危机偏高的疫病如:腹泻、手足口、红眼病、呼吸道炎、登革热，特别是暴雨洪涝过后，通过水源或动物传染的疾病。
同时组织监察受洪涝影响的地区，及时发现并彻底处理传染病疫区;清理环境，消毒水源，处理废弃物，收集与销毁死亡的家畜、家禽，不让环境污染，引致疫情爆发与蔓延。
暴雨洪涝过后，各医疗单位紧急扫除，清洁环境与消毒各科系庭院。一旦蓄水池出现水淹场合，在水退后，须进行清洁与消毒水池。
