新冠病毒在《感染症法》中被定位為“新型流感等感染症”，作出診斷的醫生必須向保健所匯報所有患者的情況。保健所在建議住院等做出處理的同時，還需要將感染者的資料登錄政府的資訊共用系統“HER-SYS”。
在奧密克戎毒株肆虐的疫情“第六波”中，感染者激增，疫情擴大地區的資料登錄滯後問題明顯。為減輕醫療一線的負擔，厚生勞動省縮小了積極流行病學調查的範圍、精簡了輸入項目等推進應對。但即便如此，有意見指出由於報告滯後，公佈的資料有可能與實際情況不符。
作為彌補報告滯後和資訊不足的方法，有人提出甄選特定的醫療機構，通過定點調查來掌握實際情況。這是在據稱每年有1000萬人感染的季節性流感中也使用的方法，具有能迅速有效地調查感染者和住院者增減與特徵的優點。不過也有觀點認為，由於有必要對新冠感染者實施就業限制和建議住院等基於法律的應對措施，因此現階段很難叫停掌握所有感染者的做法。就疫情對策向厚勞省建言獻策的專家組織成員表示：“對於新冠疫情，將觀察何種監控體制比較妥當。”◆
