對保護生物多樣性來說，人類就是最大的挑戰。人口劇增對大自然造成不可恢復的影響，導致一些自然生態體系退化，若干野生動物的種類和數量大幅減少，甚至不少珍稀動物瀕臨滅絕危機。越南依然是世界10大生物多樣性熱點地區之一，其中防範打擊販賣野生動物違法行為和保護瀕臨滅絕的動物成為保護我國生物多樣性的兩大問題。
近期，眾人經常在大眾媒體上看到沙灘堆滿垃圾或者海洋動物因誤食塑料垃圾而死亡等的報導。估計每年約有150萬隻海洋動物因誤吞塑料垃圾而死亡。另一個威脅生物多樣性的挑戰是氣候變暖。地球溫度上升、海平面上升、海水侵蝕、土地沙漠化和氣候反常等越來越激烈。在我國，尤其是九龍江平原多個省份，河岸坍塌現象日益加劇、規模日益擴大，導致這裡的防護林和一系列動植物面臨喪失危機。據預測，至2100年九龍江平原一帶的40%面積或將永遠消失，78個重點自然景區、46個自然保護區等將受到嚴重影響◆
