據伊朗官方通訊社報導，伊朗總統魯哈尼於當地時間28日發表聲明譴責襲擊行為。魯哈尼表示，這種恐怖主義行動是源於敵人在面對伊朗科學發展的能力，以及他們在該地區乃至世界接連不斷的失敗所帶來的無力感。魯哈尼強調，伊朗的敵人必須知道，暗殺行為不僅不會減弱伊朗人民加快發展科學的決心，反而使伊朗更加堅定。伊朗國防部將加大努力和投入，並通過有效的部署來填補法克里扎德的空白。此外，他對法克里扎德表示深切的哀悼。
伊朗常駐聯合國代表當天致信聯合國秘書長和安理會當月輪值主席，稱伊朗對暗殺法克里扎德予以“最強烈的譴責”，“希望聯合國秘書長和安理會強烈譴責這一非人道的恐怖主義行為，並對肇事者採取必要措施”。該信件稱，多名伊朗“頂尖科學家”在近十年遭到暗殺。“我們掌握的確鑿證據清楚地表明，某些外國勢力是這些暗殺行動的幕後黑手”，並強調“伊朗保留保護人民和本國利益的必要行動的權利。”
哈梅內伊的軍事顧問侯賽因‧德漢通過社交媒體表態，誓言要打擊殺害核子物理學家的殺手。“我們將以雷霆之勢打擊殺害烈士的兇手，並將讓他們為自己的行為感到後悔！”伊朗革命衛隊指揮官侯賽因‧薩拉米表示：“暗殺核科學家是阻止我們達到現代科學的最暴力的對抗手段”，並稱“對行兇者的嚴厲報復和懲罰已提上日程”。
另據半島電視台報導，法克里扎德遇襲身亡在伊朗引發強烈怒火，大量民眾沖上街頭進行示威抗議，要求嚴懲兇手。襲擊發生後，伊朗外長紮裏夫呼籲國際社會“譴責這類恐怖主義行徑”，並直指“有明顯跡象顯示以色列在此事中扮演了重要角色”。目前，以色列方面尚未對此次事件作出官方回應。
就伊朗科學家穆赫辛‧法克里扎德27日在德黑蘭附近遇襲身亡，聯合國秘書長副發言人哈克當天呼籲各方保持克制，避免引發中東地區局勢升級。哈克在一則聲明說：“我們敦促各方保持克制，避免採取任何可能導致該地區緊張局勢升級的行動。”
據路透社報導，雖然伊朗長期以來一直否認尋求將核能武器化，但法克里扎德一直被歐美國家和以色列描繪成2003年停止的伊朗秘密原子彈計劃的負責人。路透社報導稱，他是國際原子能機構2015年對伊朗核計劃進行“最終評估”時唯一被點名的伊朗科學家。伊朗媒體援引非官方消息人士的話透露，法克里扎德幾年前也曾遭遇暗殺，不過當時倖存了下來。據以色列《國土報》27日報導，以色列總理內塔尼亞胡2018年曾在一場新聞發佈會上將法克里扎德作為伊朗核武器項目負責人點名，“記住這個名字。”
據《紐約時報》28日報導，有美國情報部門人員認為，是以色列方面暗殺了伊朗核科學家穆赫辛‧法克里扎德，目前尚不清楚美國是否事先瞭解這一行動。《紐約時報》28日在一篇報導中透露，“一名美國官員與其他兩名情報官員稱，以色列是襲擊這名科學家的幕後黑手。”目前尚不清楚美國是否事先瞭解這一行動，但“以色列和美國是最親密的盟友，並長期交換有關伊朗的情報。”報導稱，五角大樓的前中東地區最高政策官員邁克爾‧莫爾羅伊表示，“法克里扎德是伊朗最高級的核科學家，還是伊朗伊斯蘭革命衛隊的高級官員，這一切都會使伊朗方面欲對暗殺事件進行強力回應。”美國白宮和中央情報局拒絕就此事向《紐約時報》置評，官方官員在公開場合僅表示“正在搜集情報”◆
