ODA貸款的不足之處
至今，兩個城市的都市鐵路線都採取政府開發援助（ODA）貸款形式投資。使用ODA貸款將會面臨許多不足之處，此事已經屢次提到，如：隸屬科技、我國與援助國家之間存在法理和技術的差別，導致展開過程持續拖延。世界上，沒有一個城市只靠ODA資金以建設整個都市鐵路系統。
由於使用ODA貸款，所以ODA項目都獲管理如同其他公家投資基礎設施項目般。然而，各都市鐵路項目都是超大項目，是國家級重點項目，所以須按步就班開展，如：向政府總理呈遞項目以徵得審批，制定和審批投資主張，即制定前可行性研究報告，呈遞國會審批，然後再制定投資項目，即可行性研究報告上呈政府總理。每次上呈都須向各有關部門徵得通過意見。假使一切都順利通過，僅是準備投資步驟，各都市鐵路項目就需要4至5年時間。
當獲得政府總理批准投資項目，制定基礎技術設計（FEED設計）、場地清拆補償、成立招標卷宗、選擇承包商等環節也要若干年的時間。以當前的條件，施工、試行運行工作需要至少5年。可見，一個都市鐵路項目自提出項目至投入運營需要12至15年時間。故此，如果按目前的項目管理和投資運營方式，不知何時才可按已獲批准的計劃，完成長達數百公里的都市鐵路線。延長開展或推遲施工進度，不僅造成浪費機會後果，還阻礙都市發展。
特殊管理機制
吸取周邊國家的發展投資經驗，不難發現與陸路項目不同，鐵路項目須從準備步驟、開展項目就與開拓、運營工作相連接，以開拓和運營為目標。
現在各都市鐵路線項目都採取先進技術，安全要求高，同時運營經費龐大。例如，預計每年本市鐵路1號線的運營開支達逾1萬億元，然而在起初階段從票價得來的收入僅佔總經費的30%至40%。實際證明，世界上沒有一條都市鐵路線只靠買票的收入就可以“存活”。因此，服務投資和運營鐵路線的經費都來自票價收入之外，尤其是來自各火車站周邊善於利用土地儲備面積的收入。然而，按如今的項目管理機制，從土地儲備面積獲得收入是不可行的。因此，需要為都市鐵路投資建設和運營制定新的管理模式是十分必要。
想做到此事，首先要從法理走廊著手。如上述所說，目前，我國都把都市鐵路項目和其他交通基礎設施項目一樣看待，所以尚未有專門給都市鐵路線的投資、建設、運營制定規定。
在現有的《鐵路法》，很少內容提到都市鐵路線。據此，都市鐵路線獲交給省級人委會直接決定規劃、投資、建設、運營以及開拓。然而，如上所述，與項目有關的所有事情都要上呈國會、政府總理以及各相關部門。故此，給鐵路系統的投資建設、管理運營制定另一個法律規定是十分必要的◆
