電子發票必須與稅務局數據庫鏈接
根據上述議定，組織或企業在銷售商品或提供服務時，必須使用稅務機關製作的有稅碼或無稅碼的電子發票，以稅務機關規定的標準格式提供給買方，並且必須完整記錄內容，如同超市發票。其中，增值稅發票，包括從鏈接稅務機關的電子數據庫的計算機生成的發票。銷售發票，包括從鏈接稅務機關的電子數據庫的計算機生成的發票。這些電子發票必須採用財政部提供的標準格式。該議定規定，自今年11月1日起的24個月內，個體商戶，企業必須將紙質發票轉換為電子發票。轉換電子發票之後，必須銷毀所有未使用的紙質發票。
此外，企業、經濟組織和其他組織要使用稅務機關的稅碼電子發票以銷售商品或提供服務，不區分每次交易的價值。舊議定只規定每次價值超過20萬元的交易才需要開具發票。值得注意的是，各家金融- 信貸、保險、醫療、電子商務、超市、貿易企業、組織以及經濟企業和組織必須按照規定，建立信息技術基礎設施，有會計軟件系統，電子發票製作軟件，電子發票數據儲存，確保向購買者和稅務局傳輸電子發票數據，才准提供無稅碼發票以銷售商品或服務。
換言之，許多超市以前的自有銷售、出發票軟件，無需將數據與稅務機關鏈接以便跟進。如今必須同稅務機關鏈接。稅務幹部可以在辦公室便能掌握其商業活動。對於其他高稅務風險的企業，經濟組織，必須使用具有稅務機關稅碼的電子發票。
限制個體商戶稅收損失
該議定的新要點是，定期使用10名或更多的勞動力的農林業，漁業，工業，建築業領域的個體商戶和上一年營收額在30億元以上；貿易和服務領域的個體商戶和上一年營業額是100億元以上者，必須使用有稅碼電子發票。自使用電子發票之日起的12個月內，向年營業額為30億元以上的個體商戶提供免費電子收據。
然而，一直以來稅收損失的承包稅務商戶問題是出在“平分”，這意味著納稅人和稅務機關有可能勾結，以將營收額拉低，減少應納稅款，從中牟利。這點解釋了為什麼批發市場、貿易中心的商戶每天交易數億元，但“承包稅收”額卻非常低。其實際銷售額只有在市場管理部門“報告市場商業活動的成積”時，營業額比稅務機關的報告高出許多倍時才被揭發。因此，即使轉換為電子發票，如果稅務承包商不予採用，電子發票無助於徵稅，反而加大了“足夠條件”使用電子發票的商戶與其他一般商戶之間的稅收差距。
新《議定》明確規定了稅務流失高風險行業，如直接向消費者提供服務的餐館，酒店，藥店，消費品零售店，如果條件順利的話，在今年起試行鏈接稅務機關電子數據庫的計算機生成有稅碼電子發票。根據試行的結果在全國範圍內實施。然而，經過實際考察後，發現許多商戶不想採用與稅務機關鏈接的電子發票。他們擔心稅務機關能夠清楚掌握其實際銷售額而課以更高的稅額，現時其營業由地方稅務徵稅，可以“有商有量”，靈活減少稅收，獲利更高◆
