病猪肉即使完全煮熟，仍可能因以下两个原因而导致严重感染：
1.残留细菌
一些引起猪疾病的细菌（如猪链球菌）具有很强的耐热性。以通常的烹饪方法不能完全消灭这些细菌，尤其是在它们处于厚肉深处时。一旦食用感染这种细菌的猪肉，细菌可通过消化道进入人体，引起感染。
除了猪链球菌之外，还有其他的细菌，例如：金黄色葡萄球菌。这种细菌可能产生芽孢，助其承受高温。即使猪肉已经完全煮熟，这些细菌的芽孢也可以在猪肉中存活。在食用被感染细菌芽孢的猪肉时，这些芽孢就会在人体内活化，并发展成致病细菌。根据科研结果，金黄色葡萄球菌的芽孢可以承受121摄氏度10分钟，这是医疗灭菌设备常用的灭菌温度；如果猪肉没有完全煮熟，猪肉中的寄生虫（如猪带絛虫、肝片吸虫）可以存活。
万一摄入絛虫包囊时，絛虫幼虫会移动到人体其他器官，并发展成絛虫成虫，引起危险疾病。另外，若食用未煮熟的猪肉，如猪流感、蓝耳病的一些引起猪疾病的病毒可以经由消化道传染给人类。
2.细菌毒素
如猪瘟的一些引起猪疾病的细菌可以产生毒素。正常的烹饪温度不能消灭这种毒素。猪瘟细菌产生的毒素的学名为志贺样毒素（SLT），视烹饪时间可以在不同温度下灭活。在食用含有这种毒素的猪肉时，毒素可能进入血液，并引起如败血症的严重症状。
另一方面，不卫生的食品加工，例如：刀具、切菜板等不干净可能会导致细菌交叉污染，病猪肉中的细菌可能传播到其他食品，导致人类生病，尤其是免疫力较弱的人，例如：长者、儿童、慢性病患者或正服用免疫抑制剂的人◆
